Ellen Hallabro blev matchhjälte med sitt avgörande 2-1-mål efter 73 minuter.
Matchen var mållös till Linghem tog ledningen i 37:e minuten, genom Emma Lindberg.
Åtvidaberg kvitterade till 1-1 strax före halvtidsvilan, genom Ester Orre. Det dröjde till den 73:e minuten innan Ellen Hallabro avgjorde matchen.
Förlusten var Åtvidabergs andra uddamålsförlust.
Båda lagen har haft en tuff start på säsongen. Linghem tog nu sin första seger och Åtvidaberg är helt utan poäng efter fyra spelade matcher.
I nästa omgång har Åtvidaberg LiU borta på Stångebro sportfält, torsdag 11 maj 19.00.