Kisas mål gjordes av Adam Härnström, Stephen Kigongo och Mauricio Penteado Fagotti. Elmedin Kvrgic stod för Enebys enda mål.
Kisa har tre segrar och två förluster på de senaste fem matcherna, medan Eneby har två oavgjorda och tre förluster.
För Kisa gör resultatet att man nu ligger på sjätte plats i tabellen, medan Eneby är på fjärde plats.
Eneby tar sig an Hvetlanda GIF i nästa match hemma lördag 17 september 13.30.