Uppgifter om vad som förorsakade våldet mellan de två etniska grupperingarna, hausa och birta, går isär.
Ytterligare ett 30-tal människor skadades och ett tiotal butiker i orten Roseires fick stora skador.
Militärjuntan som styr Sudan skickade den särskilda och ökända militärstyrkan RSF för att återställa ordning i området. Ett förbud att samlas och att gå utomhus nattetid har också införts.
Juntan tog makten i en kupp under hösten förra året. Då avsattes en övergångsregering som skulle föra landet i demokratisk riktning efter avsättandet av diktatorn Omar al-Bashir 2019.
Militären har dock, likt al-Bashir, haft svårt att hålla ordning i avlägsna områden söderut. I april drabbade grupper där samman i våldsamheter där fler än 200 människor dödades.